Filtry wentylacyjne chronią pacjenta, personel i urządzenia przed skażeniem mikrobiologicznym, ponieważ filtrowane jest zarówno powietrze wydechowe, jak i wdechowe. Są one w stanie skutecznie odfiltrować wszystkie rodzaje cząstek i bakterii od gazu oddechowego. Filtry wentylacyjne są stosowane w anestezjologii, intensywnej terapii i ratownictwie medycznym i mają skuteczność filtrowania do 99,99995%.

Służą one również jako wymienniki ciepła i wilgoci, dlatego znane są również jako filtry HME (Heat and Moisture Exchanger). Zapobiega to nadmiernemu zawilgoceniu gazu oddechowego, ponieważ filtr przechowuje wilgoć z wydychanego powietrza i uwalnia ją ponownie podczas wdechu.